「Nature子刊」30分钟即可检测新冠!低成本、更快速、更精确的COVID-19检测技术来了

温馨提示:很多手机浏览器,比如百度app,都可以语音播报本网页。方法打开本网页之后,点击 APP下方或上方"功能"按钮,里面有一个"语音播报"按钮,点击即可收听。

本文为转化医学网原创,转载请注明出处

作者:Daisy

导读:理想的COVID-19检测应将快速、灵敏和易用等优点结合起来,但遗憾的是,现有的基于RT-PCR的新冠检测技术无法满足这三个条件。因此,开发一种检测速度快、特异性高、灵敏度好以及易用性强的检测技术就显得尤为重要。最近,刊登在《Nature Communications》上的一项研究,DTU卫生技术研究人员开发出了一种一锅、无酶、等温检测法,快速检测SARS-CoV-2 RNA的低成本检测技术。这种“单锅检测法”,命名为NISDA检测法,特异性为100%,基于TMSD(无酶分子工具),在42°C下30分钟内检测到极低浓度的RNA。

随着大流行的爆发,你一定希望有一种快速的诊断方法,这样我们就可以迅速知道自己是否被感染了,例如,在你登机或探亲之前。

目前世界卫生组织推荐的SARS-CoV-2 RNA检测方法很大程度上需要依赖生物酶的作用。高成本、严格的运输和储存条件以及全球酶供应短缺限制了大规模检测。这意味着大多数国家必须优先对易感染病例进行检测,这会造成诊断和确定阳性病例的延误,同时也会妨碍大流行的缓解和抑制。

为了跟上新冠病毒的高传播率,SARS-CoV-2检测以创纪录的速度发展,体外诊断(IVD)市场经历了前所未有的活力。以核酸为基础的诊断方法,用于筛选鼻/口咽拭子样本中的病毒RNA,通常用于识别那些患有活动性冠状病毒感染的患者。尽管胸部计算机断层扫描(CT)和血清学检测正在用于新冠病毒的诊断,定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)仍然是全基因组检测的金标准,在控制新冠病毒大流行方面发挥着关键作用。然而,从样品到结果需要几个小时,并且该方法需要一个复杂的热循环仪器,以在离散步骤中升高和降低反应温度。

最近,研究人员在《Nature Communications》上发表了一篇题为:“A non-enzymatic, isothermal strand displacement and amplification assay for rapid detection of SARS-CoV-2 RNA”的文章,介绍了一种快速检测SARS-CoV-2 RNA的非酶等温链置换和扩增方法,这种检测方法相对于之前的检测法具有更多的优势,称为NISDA 检测法:不需要 RNA 逆转录步骤,速度快(<30 分钟),经济实惠,在室温下非常稳固(>1 个月)、等温(42 °C),可以说是一种绝佳检测。

DOI: 10.1038/s41467-021-25387-9

更简单、更便宜

非酶等温扩增法由于其简单、快速的特点,已显示出替代qRT-PCR的潜力。尽管这些方法在目标基因较短时表现良好,但它们仍不能有效地检测整个基因组(长DNA或RNA靶点)。


在新冠肺炎大流行期间,仅欧元区在2020年第一季度的GDP就下降了3.8%(欧盟统计局2020年)。因此,开发一种低成本的病原体检测方法,将对患者和旨在对抗未来流行病的医疗系统都非常有益。

DTU Health Tech的副教授孙毅(音译)和博士后研究员Mohsen Mohammadniaei共同发明了一种“单锅检测法”,他们将其命名为NISDA(非酶等温链置换和扩增方法)。该检测方法用于快速检测SARS-CoV-2 RNA,无需qRT-PCR方法中的RNA逆转录步骤。作为一个“锅”,可实现单步检测程序,即用户只需将样品添加到一根试管中,将其放置在仪器中,等待30分钟即可获得结果。

该检测在恒温下工作,不需要酶,并且基于toehold介导的链置换(TMSD)方法。TMSD是一种无酶分子工具,其中一条DNA或RNA链(输出)被另一条DNA或RNA链(输入)取代,形成更稳定的双链结构。

NISDA检测与类似分子诊断方法的比较

高精度和高灵敏度

NISDA检测能够在30分钟内检测到极低浓度的RNA(10拷贝/L)。通过与Hvidovre医院和Bispebjerg医院的合作,研究团队可以对NISDA检测进行临床验证,NISDA检测具有100%的特异性,在实验室操作时灵敏度为96.77%,在医院现场操作时灵敏度为100%。

副教授孙毅解释说:“我们利用TMSD方法,设计了三种DNA探针。一个探针将整个基因组交换成短DNA链,另外两个探针利用交换的短DNA触发荧光信号放大级联反应。NISDA检测法的优点在于简单。我们取消了酶的使用,以降低检测成本并增强其在室温下的稳定性。”

在NISDA检测的工作流程中,首先,从患者口咽拭子样本中提取RNA,然后添加到反应混合物中 ,并在42°C下培养30分钟和荧光测量,荧光信号明显高于对照样品(阴性)的样品视为阳性。当目标病毒RNA存在时,它通过INA链的toehold序列被起始者识别。然后INA开始与病毒RNA杂交,导致模板置换。这一步骤被称为“置换”,是将长病毒RNA交换成短DNA模板的过程。这一步非常关键,因为使用短模板后,后续信号放大效率更高。

NISDA检测SARS-CoV-2 RNA

面向多疾病诊断工具

博士后研究员Mohsen Mohammadniaei说:“直接参与改善人们的健康是生物医学研究人员的终极梦想,我们相信NISDA检测为我们提供了实现这一雄心的绝佳机会。”

孙毅表示:“下一步是进一步设计用于检测不同病原体的NISDA检测,并开发用于多种疾病诊断的护理点诊断设备。NISDA检测的另一个优势是它能够设计用于短RNA靶点,如癌症生物标记物microRNA。目前,我们正在探索NISDA检测商业化的不同方案,我们确信NISDA检测将在不久的将来会广为人知。”

参考资料:

https://medicalxpress.com/news/2021-09-low-cost-method-rapid-covid.html

注:本文旨在介绍医学研究进展,不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导,请至正规医院就诊。

热门·文章

基因测序

【热议】更统一、准确的基因检测如何实现?震惊!两家顶尖基因检测公司给同一批癌症患者做了液体活检,结果竟然大不相同

新冠病毒

【Nature热议】新冠病毒愈演愈烈,然而疫苗的保护效力却在逐渐削弱,我们该怎么办?

新冠病毒

【Nature热议】福建疫情已蔓延四地!以色列110万大规模研究:接种加强针比只接种过两次注射的人感染新冠的可能性低19.5倍

新冠病毒

【Science】近5亿人生活在冠状病毒可能溢出的地区,新冠只是冰山一角,还会有更多SARS样病毒!

肠道微生物

【Genome Medicine】迄今为止首个将肠道微生物数据用于类风湿性关节炎的预后研究,有望成为未来治疗的关键!

类器官研究

【Nature子刊】利用人工合成的新型凝胶可轻松培育出胰腺“类器官”,精确复制人体胰腺

肿瘤研究

【柳叶刀子刊】低剂量CT筛查肺癌真的能有效降低死亡率吗?英国科学家通过实验带你揭晓答案!

新冠病毒

【重磅】新冠疫苗对德尔塔病毒保护作用有多大?美国疾控中心给出了答案:未接种人群的死亡率是接种人群的11倍!

基因测序

【Nature子刊】迄今为止规模最大的DNAm基因研究:确定了与血液中420,509个DNAm位点的DNAm相关的遗传变异

肿瘤研究

【重磅】约翰·霍普金斯大学的科学家发现基因的自我矫正功能能够抵御血癌,这有望成为治疗血癌的重大突破!

基因检测

【Nature子刊】150万规模最大的全基因组关联研究,确定了近600个与反社会行为、酗酒、阿片类药物成瘾有关的基因位点

新冠病毒

【Nature】重磅!德尔塔变异病毒为何能够如此快速而凶猛地传播?剑桥大学的科学家带你了解它

推荐·活动

第三届上海国际癌症大会

第五届现代临床分子诊断研讨会




转载原文地址:https://baijiahao.baidu.com/s?id=1712200500998157227

作者:转化医学网

声明:本文仅代表作者观点,不代表本网站平台立场