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课程介绍

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课程特色:
1、基因组数据(plink,vcf)的清洗质控
2、构建G矩阵和一步法H矩阵的代码,提供相关代码和数据,能够很快利用相关知识分析自己的数据
3、提供交叉验证的方法,评估基因组选择的效果
4、提供 ASReml 软件,组建微信群,技术支持

适用人群

1、想要了解基因组选择数据分析的人员,帮助快速掌握该领域基础及前沿技术方法
2、及时解决短期数据分析需求(提供软件)
3、对基因组选择中数据质控,模型构建,数据分析等有疑问的人员,学完之后迅速上手分析自己的数据
4、了解确认研究中数据分析所需要分析方法及分析工具

课程大纲

01
基因组选择在育种中的应用

【录播】课程简介(3分钟)

【录播】基因组选择在育种中的应用(9分钟)
02
基因组选择(GS)中的数据准备

【录播】如何准备 基因型数据、表型数据、系谱数据(11分钟)

【资料】案例数据资料(zip,9.4MB)
03
基因组选择(GS)中的数据清洗

【录播】基因组选择中的数据清洗(19分钟)

【资料】案例数据资料(zip,9.4MB)

【资料】R 语言代码及注释文件(R,2.1KB)
04
亲缘关系矩阵构建

【录播】如何构建亲缘关系矩阵(17分钟)

【资料】案例数据资料(zip,14.7MB)

【资料】代码及注释资料:系谱构建亲缘关系A矩阵(R,0.5KB)

【资料】代码及注释资料:基因组数据构建构建G矩阵(R,0.7KB)

【资料】代码及注释资料:一步法构建H矩阵(R,1.7KB)
05
基因组选择模型构建

【录播】基因组选择模型构建、数据分析、交叉验证(25分钟)

【资料】案例数据资料(zip,14.7MB)

【资料】代码及注释资料:GBLUP基因组选择模型(R,1.7KB)

【资料】代码及注释资料:ssGBLUP基因组选择模型(R,2.4KB)

【资料】代码及注释资料-交叉验证(R,5.5KB)
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